MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Aeropyrum pernix K1

Total Repeats: 37127

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_000854	CTG	2	6	23668	23673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118430849
502	NC_000854	GCC	2	6	23717	23722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118430849
503	NC_000854	GAC	2	6	23781	23786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118430849
504	NC_000854	GTGG	2	8	23790	23797	0 %	25 %	75 %	0 %	118430849
505	NC_000854	GCT	2	6	23922	23927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118430850
506	NC_000854	CATTCA	2	12	23979	23990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118430850
507	NC_000854	GGT	2	6	24079	24084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118430850
508	NC_000854	CAG	2	6	24124	24129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118430850
509	NC_000854	AGG	2	6	24301	24306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430850
510	NC_000854	CGA	2	6	24328	24333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118430850
511	NC_000854	GCT	2	6	24418	24423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118430850
512	NC_000854	TCT	2	6	24552	24557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118430850
513	NC_000854	CCA	2	6	24588	24593	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118430850
514	NC_000854	CTA	2	6	24767	24772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118430850
515	NC_000854	CCCG	2	8	24778	24785	0 %	0 %	25 %	75 %	118430850
516	NC_000854	TGGC	2	8	24791	24798	0 %	25 %	50 %	25 %	118430850
517	NC_000854	AGA	2	6	24809	24814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118430850
518	NC_000854	AGG	2	6	24850	24855	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430851
519	NC_000854	GTT	2	6	24880	24885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118430851
520	NC_000854	GCT	2	6	24924	24929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118430851
521	NC_000854	GTT	2	6	24942	24947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118430851
522	NC_000854	GTG	2	6	24990	24995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118430851
523	NC_000854	TA	3	6	25075	25080	50 %	50 %	0 %	0 %	118430851
524	NC_000854	CT	3	6	25083	25088	0 %	50 %	0 %	50 %	118430851
525	NC_000854	TAG	2	6	25091	25096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118430851
526	NC_000854	AGC	2	6	25122	25127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118430851
527	NC_000854	GCA	2	6	25138	25143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118430851
528	NC_000854	CAG	2	6	25219	25224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118430851
529	NC_000854	TGG	2	6	25229	25234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118430851
530	NC_000854	TCC	2	6	25244	25249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430851
531	NC_000854	AAT	2	6	25287	25292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118430851
532	NC_000854	ATA	2	6	25324	25329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118430851
533	NC_000854	TTC	2	6	25330	25335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118430851
534	NC_000854	GAA	2	6	25338	25343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118430851
535	NC_000854	CTT	2	6	25344	25349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118430851
536	NC_000854	GGC	2	6	25377	25382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118430851
537	NC_000854	TGC	2	6	25427	25432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118430851
538	NC_000854	AGC	2	6	25489	25494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118430851
539	NC_000854	TTC	3	9	25495	25503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118430851
540	NC_000854	GCTG	2	8	25629	25636	0 %	25 %	50 %	25 %	118430851
541	NC_000854	TA	3	6	25660	25665	50 %	50 %	0 %	0 %	118430851
542	NC_000854	GGCTG	2	10	25678	25687	0 %	20 %	60 %	20 %	118430851
543	NC_000854	GTT	2	6	25730	25735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118430852
544	NC_000854	TTC	2	6	25796	25801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118430852
545	NC_000854	TCC	2	6	25803	25808	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430852
546	NC_000854	ACG	2	6	25835	25840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118430852
547	NC_000854	GGA	2	6	25897	25902	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430852
548	NC_000854	GT	3	6	25977	25982	0 %	50 %	50 %	0 %	118430852
549	NC_000854	ACA	2	6	25986	25991	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118430852
550	NC_000854	AGG	2	6	26012	26017	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430852
551	NC_000854	CTAA	2	8	26030	26037	50 %	25 %	0 %	25 %	118430852
552	NC_000854	GAC	2	6	26039	26044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118430852
553	NC_000854	G	6	6	26123	26128	0 %	0 %	100 %	0 %	118430852
554	NC_000854	CAG	3	9	26129	26137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118430852
555	NC_000854	CTC	2	6	26216	26221	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430852
556	NC_000854	GAA	2	6	26245	26250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118430852
557	NC_000854	AGT	2	6	26350	26355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118430852
558	NC_000854	GAG	2	6	26372	26377	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430852
559	NC_000854	AC	3	6	26395	26400	50 %	0 %	0 %	50 %	118430852
560	NC_000854	TCG	2	6	26403	26408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118430852
561	NC_000854	CCG	2	6	26426	26431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118430852
562	NC_000854	AGG	2	6	26501	26506	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430852
563	NC_000854	GAG	2	6	26513	26518	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430852
564	NC_000854	GAG	2	6	26521	26526	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430852
565	NC_000854	AT	3	6	26555	26560	50 %	50 %	0 %	0 %	118430852
566	NC_000854	ATA	2	6	26687	26692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118430852
567	NC_000854	TTGC	2	8	26847	26854	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
568	NC_000854	AC	3	6	26871	26876	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
569	NC_000854	AT	3	6	26901	26906	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_000854	TA	3	6	26912	26917	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_000854	CTAT	2	8	26928	26935	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
572	NC_000854	GAA	2	6	26949	26954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
573	NC_000854	AATA	2	8	26964	26971	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_000854	AAG	2	6	27003	27008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14600404
575	NC_000854	GCTG	2	8	27023	27030	0 %	25 %	50 %	25 %	14600404
576	NC_000854	TTG	2	6	27031	27036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	14600404
577	NC_000854	CTGG	2	8	27067	27074	0 %	25 %	50 %	25 %	14600404
578	NC_000854	GA	3	6	27091	27096	50 %	0 %	50 %	0 %	14600404
579	NC_000854	AGT	2	6	27122	27127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14600404
580	NC_000854	AT	3	6	27153	27158	50 %	50 %	0 %	0 %	14600404
581	NC_000854	GAG	2	6	27180	27185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14600404
582	NC_000854	AGA	2	6	27190	27195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14600404
583	NC_000854	ATTA	2	8	27213	27220	50 %	50 %	0 %	0 %	14600404
584	NC_000854	CTC	2	6	27292	27297	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600404
585	NC_000854	ACA	2	6	27376	27381	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	14600404
586	NC_000854	GGA	2	6	27392	27397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14600404
587	NC_000854	GA	3	6	27439	27444	50 %	0 %	50 %	0 %	14600404
588	NC_000854	AGCC	2	8	27488	27495	25 %	0 %	25 %	50 %	14600404
589	NC_000854	TCC	2	6	27565	27570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600404
590	NC_000854	GGA	2	6	27596	27601	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14600404
591	NC_000854	AGG	2	6	27653	27658	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14600404
592	NC_000854	GTC	2	6	27684	27689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14600404
593	NC_000854	GAT	2	6	27780	27785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14600404
594	NC_000854	GAC	3	9	27861	27869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14600404
595	NC_000854	ACG	2	6	27883	27888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14600404
596	NC_000854	ATA	2	6	27891	27896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14600404
597	NC_000854	CCT	2	6	27928	27933	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600404
598	NC_000854	TCC	2	6	27940	27945	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600404
599	NC_000854	AAG	2	6	27990	27995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14600404
600	NC_000854	ATC	2	6	28032	28037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14600404
601	NC_000854	TA	3	6	28044	28049	50 %	50 %	0 %	0 %	14600404
602	NC_000854	CGA	2	6	28058	28063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14600404
603	NC_000854	GAT	2	6	28094	28099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14600404
604	NC_000854	GACC	2	8	28149	28156	25 %	0 %	25 %	50 %	118430853
605	NC_000854	CTT	2	6	28157	28162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118430853
606	NC_000854	TAC	2	6	28230	28235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118430853
607	NC_000854	CCAGG	2	10	28303	28312	20 %	0 %	40 %	40 %	118430853
608	NC_000854	CTA	2	6	28323	28328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118430853
609	NC_000854	CGT	2	6	28367	28372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118430853
610	NC_000854	CT	4	8	28388	28395	0 %	50 %	0 %	50 %	118430853
611	NC_000854	GGA	2	6	28412	28417	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430853
612	NC_000854	ATG	2	6	28473	28478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118430853
613	NC_000854	CCTT	2	8	28519	28526	0 %	50 %	0 %	50 %	118430853
614	NC_000854	CCT	2	6	28634	28639	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430853
615	NC_000854	AT	3	6	28665	28670	50 %	50 %	0 %	0 %	118430853
616	NC_000854	GGT	2	6	28673	28678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118430853
617	NC_000854	AAC	2	6	28736	28741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118430853
618	NC_000854	ATTG	2	8	28802	28809	25 %	50 %	25 %	0 %	118430853
619	NC_000854	GA	3	6	28828	28833	50 %	0 %	50 %	0 %	118430853
620	NC_000854	CAT	2	6	28894	28899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118430853
621	NC_000854	CT	3	6	28910	28915	0 %	50 %	0 %	50 %	118430853
622	NC_000854	CT	4	8	28940	28947	0 %	50 %	0 %	50 %	118430853
623	NC_000854	TAA	2	6	29105	29110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14600406
624	NC_000854	ATA	2	6	29140	29145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14600406
625	NC_000854	TTC	2	6	29197	29202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14600406
626	NC_000854	CCA	2	6	29218	29223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	14600406
627	NC_000854	CAT	2	6	29292	29297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14600406
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629	NC_000854	TAG	2	6	29432	29437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14600406
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